35 000 rokov pred naším letopočtom. Dvojica praľudí sa v tmavej jaskyni stretáva so záhadnou, nepriateľskou bytosťou, zjavne mimozemského pôvodu. Tečie krv a taktiež zvláštna čierna kvapalina, človek je vystrašený. O 37 000 rokov neskôr vstupuje podobná tekutina do života skupiny detí a vzápätí aj niekoľkým záchranárom. V kancelárskej budove v Dallase je nájdená časová nálož, ktorá neskôr vybuchne a nikto zatiaľ netuší, aká je medzi oboma udalosťami spojitosť. Na tú a na hromadu ďalších vecí musia prísť až agenti FBI Mulder (David Duchovny) a Dana Scullyová (Gillian Andersonová). Tí čelia obvineniam zo zabitia niekoľkých ľudí. Ako to, že sú ale mŕtvi, keď v zdemolovanej budove v dobe výbuchu ani neboli, prečo, keď už sú mŕtvi, vyzerajú ich telá ako obrie želatínové medvedíky a konečne čo je zač ten zvláštny vírus, ktorý mŕtvoly vyrobil ?
Tajomné konšpirácie, nevysvetlené záhady, paranormálne javy, stretnutia s budúcnosťou, agenti FBI Fox Mulder a Dana Scullyová - to sú v kocke atributy prvého celovečerného filmu so značkou Akty X. Ide o kompletnú novinku, vo filme teda nie je použitý jediný záber z TV seriálu, ani zo série vydanej na videokazetách.
